Protokół AH jest rzadko używany w nowoczesnych sieciach VPN z kilku powodów. Po pierwsze, AH nie szyfruje danych, zapewniając jedynie integralność i uwierzytelnianie. Po drugie, AH działa na oryginalnym nagłówku IP, co powoduje problemy z translacją NAT. Modyfikacja adresu IP przez NAT narusza integralność obliczaną przez AH, co powoduje odrzucenie pakietu.
ESP jest zdecydowanie dominującym wyborem, ponieważ zapewnia zarówno szyfrowanie, jak i integralność. W trybie tunelowym ESP enkapsuluje cały oryginalny pakiet IP, co pozwala na bezpieczne przesyłanie ruchu między sieciami. ESP używa protokołu IP numer 50, który musi być przepuszczany przez zapory sieciowe.
W praktyce konfiguracyjnej na routerach MikroTik domyślnie używany jest ESP, co jest właściwym wyborem. Jeśli w konfiguracji widzimy opcję wyboru między AH a ESP, zawsze należy wybrać ESP. Warto również pamiętać, że nowoczesne implementacje IPSec obsługują tryb ESP z integralnością, co eliminuje potrzebę stosowania AH nawet w scenariuszach wymagających wyłącznie weryfikacji autentyczności.